Mendelian randomization - Critical appraisal checklist MR 연구를 진행할 때 가장 중요한 Checklist들을 한눈에 보기 쉽게 나열하였다. 1.Core MR assumption (relevance assumption, independence assumption, exclusion restriction)을 만족하는가?horizontal pleiotropy에 대해서는 authors가 alternative MR approach, such as MR Egger, median, and mode estimators or use of "negative control" populations를 이용하여 조사하였는가? 참고) Mendelian Randomization (2) - How to solve genetic pleiotropy? (tistory.com) Mende.. 2024. 9. 21. Mendelian Randomization (2) - How to solve genetic pleiotropy? MR의 전제조건에서 다뤘듯이, Genetic variant는 risk factor를 경유하지 않고 outcome에 영향을 주지 않아야 한다. (aka. exclusion restriction) 하지만 실상 이런 경우를 strict하게 지키기는 쉽지 않기 때문에, 다양한 추정 방법들이 존재하게 되는데, median estimator와 MR Egger regression이 그것이다. 전자는 적어도 절반은 pleiotropic effect가 없다 가정한다. Egger regression은 본래 meta-analysis에서 small study bias (작은 연구일수록 더 dramatic한 결과를 싣기 쉬워 bias가 생기기 쉽다)를 detect하기 위한 tool이었다. Egger regression에서의 .. 2024. 9. 20. 이전 1 다음
