PRS calculation (2024 GENESIS-K 유전체 강의 정리) PRS 계산의 Concept은 아래와 같다. PRS는 Risk allele들의 합산 score로 계산되는데, 해당 SNP의 Weight인 effect size가 가장 중요하다. 이 Beta distribution을 어떻게 추정하는지가 오늘의 주제다.미리 결론부터 말하자면 PGS Catalogue에 등재된 PGS 있다면 그대로 사용하는 것을 권한다. 이러한 방법으로는 크게 C-T (Clumping + Thresholding), Shrinkage, Bayesian approach로 나누어진다. 1. C-T : PRSice2 C-T든 P-T(Pruning)는 모두 LD relationship을 고려해서 가장 관계된 SNP만을 선택하는 과정이다.Threshold의 경우 best-fit PRS를 제공하기 위해.. 2024. 8. 26. 이전 1 다음
